Namun secara garis keturunan darah Klan Otsutsuki masih mengalir dalam klan-klan keturunan mereka seperti Senju, Uzumaki, Uchiha, dan Hyūga.
Dialah ibu dari para leluhur klan shinobi yang saat ini ada. Menurut alur cerita Naruto, Kaguya memakan buah dari pohon chakra untuk mendapatkan kekuatan dewa guna mengakhiri konflik manusia di bumi yang tiada akhir.
Namun setelah mempunyai anak, kekuatan chakra dalam tubuh Kaguya mulai mengubah sifatnya.
Kaguya mulai tidak percaya lagi dengan manusia, dan berencana untuk menggunakan jutsu infinite Tsukuyomi untuk menjebak seluruh manusia dalam genjutsu.
Namun aksinya tersebut digagalkan oleh kedua anak kembarnya, yang kemudian menyegel Kaguya.
Menjadikannya sebagai leluhurnya para shinobi yang lebih dikenal dengan nama "Rikudo Sanin." Bersama dengan saudara kembarnya, dia berhasil menyegel Kaguya yang ingin menggunakan jutsu infinite Tsukuyomi.
Setelah Hagoromo mengekstrak biju ekor 10 menjadi 9 ekor biju, Hamura memilih untuk tinggal di Bulan dan menjaga segel Kaguya agar tidak terlepas lagi.
Namun karena kekuatan tersebut, Indra menjadi seorang yang penyendiri. Dia merasa tidak membutuhkan orang lain.
Karena sifatnya itu, Hagoromo lebih memilih adiknya Indra sebagai penerus penjaga perdamaian di Bumi.
Akibar dari pengaruh Black Zetsu, Indra akhirnya terprovokasi untuk bertarung dengan adiknya.
Namun karena itu, Asura menjadi seorang yang supel. Dia berpikir cinta dan persahabatan adalah jalan terbaik untuk menjagai perdamaian dibandingkan dengan kekuatan.
Oleh karena pemikirannya tersebut, Hagoromo lebih memiliki Asura untuk menjadi pewarisnya.
Dapatkan Koleksi jaket-Jaket Anime Paling keren
Hanya di Otaku Indonesia Shop
Indra dan Ashura akhirnya bertarung sampai mati. Namun sebelum keduanya mati, mereka sudah memiliki keturunan yang pada akhirnya terus mengulang sejarah hingga Uchiha vs Senju.
Dia merasa benci kepada manusia karena menggunakan chakra sebagai senjata untuk saling berperang.
Toneri juga jatuh cinta kepada Hinata Hyuga. Itulah kesalahan fatal yang membuatnya harus tewas ditangan Naruto.
Karakter ini muncul begitu saja. Tidak diketahui dari mana asalnya, dan tidak juga diketahui dia itu keturunan dari Hagoromo atau Hamura. Namun yang jelas dia adalah penyandang nama klan Otsutsuki.
Dia seperti seorang pendetanya klan Otsutsuki yang begitu setia kepada Hamura. Dialah yang memberitahu Hinata tentang Tenseiga dan sejarah klan Otsutsuki. Namun sayangnya tidak disebutkan siapa namanya.